HRM, a técnica inovadora para a detecção de Botrytis pseudocinerea, uma espécie recentemente descoberta em frutas e culturas
Laboratorios Diagnofruit Ltda., É uma empresa chilena fundada no ano 2012 por agrônomos, com o objetivo de desenvolver pesquisas e prestar serviços que atendam às necessidades da indústria de frutas do país.
Entre seus clientes estão alguns dos exportadores mais importantes do país, como Frusan, Dole e Subsole, empresas agroquímicas e associações comerciais, como o Comitê Kiwi.
Além de diagnosticar a qualidade do fruto - ferramenta de suporte exportação no processo de segregação de pomares para salvar estendido - Diagnofruit é um revelador activo de técnicas e tecnologias para a detecção, diagnóstico de agentes patogénicos e estudo das relações filogenéticas entre espécies , pathovars e / ou genótipos.
Nesta última área de desenvolvimento, o Diagnofruit, em cooperação com o Centro de Pesquisas Biomédicas da Universidade Autônoma do Chile, gerou uma técnica altamente sensível e altamente eficiente para a detecção de duas importantes espécies do gênero. Botrytis, como ele é Botrytis cinerea e Botrytis pseudocinerea.
Por que é importante saber quais espécies de botrytis dominam na minha cultura?
Existem algumas variantes crípticas e simpátricas de botrytis, isto significa que elas não podem ser diferenciadas a olho nu e que podem ocupar o mesmo nicho ecológico. Pesquisa de uva de mesa nos anos 90 na França e mais recente no Chile, caracterizada B. pseudocinerea como natural e intrinsecamente resistente à fenhexamida, foram detectados isolados resistentes à molécula, mesmo sem ter recebido aplicações de fenhexamida antes.
Essa importante característica condiciona o planejamento de programas de controle químico baseados na população botrytis dominante no campo, gerando a importância de se conhecer a freqüência de ambas as espécies.
O que é essa nova técnica?
A técnica é baseada em uma variante do qPCR e é chamada HRM por sua sigla em inglês (High Resolution Melting). Esta técnica, entre outras características, pode detectar variações mínimas no genoma de qualquer organismo, sendo capaz de discriminar entre B. cinerea e B. pseudocinerea.
Quais são as vantagens da HRM em relação às técnicas convencionais?
A técnica convencional tem várias etapas e, muitas vezes, se a extração do DNA não for eficiente o suficiente, gera bandas difíceis de visualizar em um gel de agarose típico.
A técnica de HRM não utiliza gel de agarose, mas é uma interpretação direta de um pequeno setor do genoma do fungo, portanto, é muito mais eficaz e eficiente, reduzindo os tempos de análise em 55% e aumentando a sensibilidade do gel. detecção significativamente.
Como a estação é projetada em termos de qualidade e conservação de espécies de frutas, como uvas, onde variedades como a Thompson S. são altamente suscetíveis a ataques de B. cinerea e B. pseudocinerea?
Héctor García, gerente geral da Laboratorios Diagnofruit Ltda., Disse que "Embora tenha sido uma nascente muito quente na área central, acima do normal e com ondas de calor sucessivas, o que geralmente é positivo se o risco for bem gerenciado, foi detectado que o calor extremo no verão pode causar problemas no ambiente. maturação (precocidade) acompanhada de maior dificuldade no acúmulo de matéria seca devido ao estresse térmico, mesmo comportamento registrado no início das cerejas este ano".
"Em termos de colonização por botrytis em flor, há duas realidades muito distintas, em áreas iniciais onde as chuvas perto flor ocorreram, o controle era pobre e há um alto risco de desenvolver infecções na colheita e pós-colheita, por isso temos gerou com nossos clientes planos de gestão específicos nessas unidades. Por outro lado, as zonas de florescimento tardio apresentaram, em geral, níveis de colonização por botrítis em freqüências mais baixas, resultando em menor risco de frutificação."Ele acrescentou.
Fonte: Fruit Portal
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