La principal área de investigación del Dr. Juan Hirzel es la fertilidad de suelos y nutrición vegetal. Como destacado investigador del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA) y como profesor del Doctorado en Ciencias Agrarias de las universidades de Talca y de Concepción en Chile, ha colaborado en proyectos de investigación para desarrollo de metodologías para manejo sectorizado de fincas, aplicación de técnicas de análisis de imágenes multiespectrales para optimizar cosechas, entre otros. Además ha desarrollado herramientas para toma de decisiones en la producción orgánica de arándanos para exportación, así como trabajos sobre los efectos de fertilizantes orgánicos sobre los parámetros vegetativos, nutricionales y productivos en arándanos.

Durante más de 35 años se ha dedicado a la investigación de la fisiología de frutales menores, en particular arándanos y ha participado en programas de mejoramiento genético.  Fue subdirector del grupo de trabajo de Frutilla de la Sociedad Internacional de Ciencias Hortícolas (ISHS), en la cual representó a Chile por 12 años y presidente de la Sociedad Chilena de Fruticultura. Dentro de su larga trayectoria obtuvo en el año 2002 una beca del Ministerio de Ciencia y Tecnología de Japón para estudiar fisiología de frutilla en la Universidad de Yamagata. Ha publicado numerosos artículos y a mediados del 2018 se ha publicado la segunda edición revisada y actualizada del libro “Blueberries”.  Ejemplares que estarán a la venta en el seminario.