L'avenir de la filière myrtille est marqué par une concurrence qui ne se limite plus aux champs, mais aussi aux laboratoires de génomique et de biotechnologie. L'amélioration génétique est essentielle pour garantir un approvisionnement stable, de qualité et compétitif, et ceux qui progresseront dans cette course seront mieux positionnés pour les marchés de 2030 et 2050.

Technologies, objectifs et projections

L'amélioration génétique du bleuet entre dans une nouvelle phase, accélérée par la convergence de la génomique, du phénotypage de haute précision, des biotechnologies et des techniques de sélection accélérée. À court terme (5 ans), nous assisterons à une adoption croissante des schémas de sélection. Sélection génomique et des marqueurs moléculaires pour accélérer la sélection de descendances avec une plus grande fermeté, une meilleure qualité de fruits et une meilleure résistance aux pathogènes.

À moyen terme (10 à 20 ans), la combinaison de l’édition génétique ciblée (CRISPR/Cas) – pour les caractères complexes lorsque la réglementation et l’acceptation le permettent – ​​avec des stratégies d’amélioration assistées par phénotypage »Élevée-débit« et le développement de variétés entièrement adaptées au stress hydrique et thermique transformeront encore davantage la productivité des cultures et leur adaptation aux changements climatiques ou aux zones géographiques difficiles.

Génomique et sélection génomique (Sélection génomique)

La sélection génomique (SG) permet de prédire la valeur génétique des jeunes individus grâce à des marqueurs pangénomiques, réduisant ainsi les cycles d'évaluation traditionnels. Chez les myrtilles, une culture pérenne aux cycles juvéniles longs, la SG est particulièrement précieuse car elle permet d'éliminer précocement les descendants peu prometteurs et de concentrer les ressources sur les lignées supérieures. À court terme, les programmes privés et publics disposant déjà de collections phénotypées verront leurs résultats rapidement grâce à des améliorations de la fermeté, de la taille et du délai de récolte.

Phénotypage de haute précision (Phénotypage à haut débit)

L'utilisation de capteurs (imagerie hyperspectrale, caméras multicapteurs, drones, plateformes de terrain) et de mesures automatisées de fermeté et de couleur permettra de relier des caractères phénotypiques complexes à des marqueurs génomiques. Cela accélère l'apprentissage des modèles GS et améliore leur précision.

Édition génétique et biotechnologie

L'édition génique ciblée (CRISPR/Cas) offre la possibilité de modifier des gènes ayant des effets significatifs sur des caractères tels que la résistance à certaines maladies, la tolérance au stress thermique ou la production de composés volatils responsables de l'arôme. Son déploiement commercial dépendra des cadres réglementaires et de l'acceptation du marché. Dans les régions où les pratiques sont favorables à la réglementation, des cultivars modifiés pourraient être testés et homologués d'ici la deuxième décennie (10 à 15 ans).

Mécanisation

La sélection de caractéristiques favorisant la récolte mécanisée (tiges plus droites, fruits plus fermes et chute uniforme) deviendra une priorité afin de réduire les coûts de main-d'œuvre. Des programmes de sélection ciblant ces caractéristiques sont déjà en cours chez plusieurs obtenteurs privés.

Que cherchera-t-on à améliorer avec l’amélioration ?

• Une plus grande fermeté des fruits et une durée de vie après récolte plus longue pour faire face aux longues chaînes logistiques et aux marchés éloignés.
• Calibre et homogénéité des fruits supérieurs en raison des exigences de la vente au détail.
• Résistance ou immunité aux principaux agents pathogènes, tels que botrytis, phytophthora, les nématodes et les ravageurs émergents tels que Drosophila suzukii.
• Tolérance thermique et à la sécheresse/salinité. Adaptation au changement climatique et au stress hydrique.
• Caractéristiques adaptées à la récolte mécanique : architecture de la plante et caractéristiques de chute.
• Meilleur profil organoleptique : arôme, sucre/acide, composés bioactifs (anthocyanes) pour la valeur nutritionnelle et premiumisation.
• Facilité de propagation et âge juvénile plus bas, pour raccourcir le cycle commercial.

Les myrtilles ont cessé d'être une culture de niche pour devenir la baie la plus dynamique au monde. La demande connaît une croissance à deux chiffres sur les marchés émergents et établis, et la concurrence entre les pays producteurs a propulsé le secteur vers une nouvelle ère : il ne suffit plus de produire plus ; il faut produire mieux. Dans ce contexte, l'amélioration génétique apparaît comme l'une des clés du maintien de la compétitivité, de la réduction des coûts et de l'adaptation aux défis climatiques et logistiques.

* Cet article est un extrait d’un long article qui sera publié dans le prochain numéro de Blue Magazine.